Basado en la saga de juegos de RPG del mismo nombre desarrollado para Playstation. La historia se sitúa 10 años después de la historia del juego "Persona 3", de PS2. Sus calles, sus construcciones... Todos los habitantes de Ayanagi parecen los mismos, pero incluso un par de forasteros como Shin y Jun Kazato pueden darse cuenta de que algo ha cambiado, algo que sumergió a esta ciudad en un letargo mortal, algo que sus pobladores han borrado de su memoria. Dispuestos a sanar viejas heridas, Shin y Jun han llegado a Ayanagi en busca de Ryo, su hermano mayor, de quien se separaron hace casi diez años y que ahora es jefe del departamento de policía de Ayanagi. Frío y calculador, Ryo Kazato es considerado por sus subordinados como un oficial prodigio, responsable de que la ciudad haya recuperado el control y una relativa tranquilidad; pero, en semanas recientes, Ryo ha sido testigo de inexplicables eventos que, aunque distintos, parecen ser parte de una amenaza mayor... Desapariciones colectivas, masacres en suburbios, jóvenes que pierden la razón y son consumidos por la violencia... Devastadoras tragedias que Ryo y el departamento se esfuerzan en mantener en secreto, temerosos de que esta información pueda desatar una oleada de histeria colectiva. Por su cuenta, Ryo empieza a descubrir la verdad detrás de la tenebrosa aura que rodea a Ayanagi, el preludio a una catástrofe que solo unos cuantos recuerdan como "la Hora Oscura". Mientras tanto, intentando reconstruir el misterioso pasado de Ryo, Shin y Jun se encuentran frente a frente con una criatura de otro mundo, un Persona... la clave para revelar todos los secretos del pasado, presente y futuro de esta ciudad.

El director es Jun Matsumoto, conocido por su trabajo en "Blood+" y "Digimon". Los diseños originales corren a cargo de Shigenori Soejima, de Atlus, mientras que la adaptación de los mismos para el anime será responsabilidad de Yuriko Ishii ("Ouran High School Host Club", "The Prince of Tennis"). Yasuyuki Muto lidera el equipo de guionistas en el que se incluye Shinsuke Onishi ("Darker than Black"), y Shogo Yasukawa. Por su parte, el diseño de los Persona, las entidades supernaturales de la serie, es trabajo de Nobuhiko Genma. Finalmente, la música será obra de Taku Iwasaki, conocido por haber participado en "Lunar Silver Star Story Lunatic Festa" y "Read or Die".